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高保真DNA聚合酶究竟有哪些魔力呢?
發布時間: 2021-09-26 點擊次數: 2920次作用原理
高保真DNA聚合酶含有聚合中心和酶切中心[1],聚合中心具有5’-3’聚合酶活性,負責聚合作用;酶切中心具有3’-5’外切酶活性(也稱校對活性),負責將不配對的核苷酸予以切除。
在PCR擴增過程中,當引物與模板*互補后,進入聚合中心,在聚合酶活性作用下,游離的脫氧核苷酸通過互補配對原則,依次結合到引物的3’端,新鏈DNA從5’到3’進行延伸(圖1-a);當引物末端結合的核苷酸與模板不配對時(圖1-b),錯配的核苷酸會翹起,新鏈DNA無法繼續向前延伸,進而進入酶切中心,在外切酶活性作用下,錯配的核苷酸會被切除(圖1-c);切除后此位點會重新結合正確的核苷酸,新鏈DNA又能繼續從5’到3’進行延伸(圖1-d),最終使新鏈DNA能夠進行精準復制[1-2]。
圖1. 高保真DNA聚合酶工作原理示意圖[1-2]
應用方向
基因功能研究
案例:研究表明A基因可能參與擬南芥中花青素的代謝,為了驗證這一假設,要先將A基因從擬南芥中擴增出來,構建到過表達或抑制表達載體上,通過農桿菌介導法轉入擬南芥中,使A基因在擬南芥體內過表達或抑制表達,最后通過形態指標、生理指標及基因表達水平等來判定這一假設是否成立。
基因測序
案例:若想探究擬南芥中B蛋白家族中不同基因的異同點,需要先將B蛋白家族中的所有基因從擬南芥中擴增出來,得到這些基因的堿基序列,然后通過生物信息學分析來初步分析它們的異同點。
以上研究均需借助PCR技術將目的基因從物種中精準擴增出來,如果擴增出的基因序列出現突變,那么后續分析都會不準確;為了保證目的基因的精準擴增,我們在PCR擴增過程中就需要使用高保真DNA聚合酶。
此外,高保真DNA聚合酶也可以用于基因型鑒定。 答疑劇場 問Q1:高保真DNA聚合酶擴增產物為平末端,后續做TA克隆,如何在產物末端加A? 答:反應體系:10 µl
①單酶:1 µl 10×Taq Buffer(MgCl2 Plus),0.5 µl dNTP Mix (10 mM),0.2 µl Taq DNA Polymerase,1-7 µl純化后PCR片段,ddH2O補齊至10 µl
②Mix:5 μl 2×Taq Master Mix,1-5 µl純化后PCR片段,ddH2O補齊至10 µl 反應程序:72℃,10 min 問Q2:高保真酶DNA聚合酶擴增的片段一定不會突變嗎?
答:高保真DNA聚合酶具有3’-5’的外切酶活性,在PCR擴增過程中可降低核苷酸錯配的概率,保真度越高的DNA聚合酶,核苷酸錯配的概率就會越低,但不表示擴增過程中絕對不會發生核苷酸的錯配。因此,為了提高實驗的成功率,建議同一樣本挑取多個(>3個)單克隆進行測序。
問Q3:不同公司高保真DNA聚合酶的保真度有可比性嗎?
答:高保真酶的保真度通常表示為是Taq酶的幾倍,常見的保真度測定方法有:藍白斑篩選測定、一代測序和NGS測序等。不同品牌DNA聚合酶的保真度測定方法不同,若想要比較不同品牌DNA聚合酶的保真度,必須采用相同的保真度測定方法,進行平行比對。
快速高保真酶推薦
參考文獻:
[1] 黎景光. DNA聚合酶高保真原理應用于SNP檢測的研究[D]. 暨南大學, 2006.
[2] Steitz TA. DNA polymerases: structural diversity and common mechanisms. J Biol Chem, 1999, 274(25): 17395–17398.
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